تمتلك جامعة عين شمس 4 متاحف أثرية فريدة، لما تحتويه من تحف تحمل في ثناياها قامة علمية وتاريخية، وتعد مادة خام يطلع من خلالها كل طالب بالجامعة على ما درسه بالكتب، حيث تعود مقتنيات هذه المتاحف على عقود مضت، وبعضها ليس له مثيل في متاحف أخرى خارج الجامعة.
ونسرد لكم خلال السطور التالية هذه المتاحف واهم مقتنياتها:
1- المتحف العلمي للصخور والمعادن والحفرياتبقسم الجيولوجيا
يقع المتحف في الدور الأرضي بالمبنى القديم للكلية بقسم الجيولوجيا وهو من أقدم المتاحف الجيولوجية بمصر حيث يرجع تاريخ إنشائه إلى الخمسينيات مع افتتاح جامعة عين شمس .
ويحتوي المتحف على مجموعات متنوعة من الصخور والمعادن والحفريات والظواهر الجيولوجية التي تساعد الطلاب والباحثين في مجالات جيولوجية مختلفة.
ويمتلك المتحف على أكثر من 3000 عينة قام بجمعها أعضاء هيئة التدريس بالقسم ومعاونيهم من خلال رحلاتهم البحثية والمنهجية إلى جميع مناطق مصر .
كما يضم المتحف أيضا مجموعات من العينات النموذجية التي جمعت من قبل بعض العلماء الأجانب أو خريجي القسم وهي:"مجموعة الملك فاروق، مجموعة المعادن والصخور، مجموعة جيولوجيامصر، مجموعة الحفريات والتتابع الحفري، مجموعة الجمعية المصرية لعلم الرسوبيات، مجموعة الأستاذ الدكتور حيدر عنان العضو السابق بقسم الجيولوجيا".
2- الحديقة النباتية
يتكون المتحف على عدة دواليب تحتوي على مجسمات للتراكيب الزهرية، ومجسمات توضح مراحل إنبات البذور، ومجسمات توضح التراكيب الداخلية لقطاعات مستعرضة في الجذور وقمتها النامية، ونماذج لأنواع مختلفة من الثمار، عدد 18 لوحة زجاجية بها نماذج مجففة من الأوراق تمثل الأشكال المختلفة للأوراق، و9 لوحات تحتوي على نماذج لأنواع مختلفة من البذور الجافة والأخشاب واستخداماتها.
كما يوجد به 9 لوحات مصورة للقطاعات المختلفة التي يستعان بها فى الدراسة العلمية للطلاب، ومجسم يوضح الطور المشيجي يحمل الطور البوغي الحديث للنبات، 24 لوحة مرسومة لنبات تنتمي لفصائل مختلفة تشمل،مجسم يوضح دورة حياة الماركانتيا، ونماذج مجففة لثمار مصابة توضح أعراض بعض الأمراض التى تصيب بعض النباتات
3- المتحف العلمي للحيوانات
وتم تأسيسه في متحف قسم علم الحيوان بكلية العلوم جامعة عين شمس مع بداية إنشاء القسم عام 1950م في عهد الدكتور كامل منصور نيروز رئيس قسم علم الحيوان آنذاك، حيث يعد هذا المتحف من أجمل المتاحف تنسيقا وإحتواءًالإكبر قدر من العينات إذا ما قورن بمتاحف الجامعات الأخرى،ويحتوى المتحف على عدد كبير من العينات المرجعية تمثل طوائف عديدة من المملكة الحيوانية.
ويضم المتحف عدة مجموعات وهي مجموعة اللافقاريات، ومجموعة الفقاريات، ومجموعة واصف المرجعية والتيأسسها الأستاذ الدكتور كمال ميخائيل واصف.
4- المتحف العلمي للحشرات
بدأ القسم فيعمل المجموعة الحشرية منذ عام 1950م عندما كان القسم تابعا لمعهد المعلمين العالي وعند إنشاء جامعة هليوبوليس، وأصبح قسم علم الحشرات مستقلا برئاسة الأستاذ الدكتور محمد طاهر السيد، ويضم المتحف عدة مجموعات حشرية هي " المجموعة المرجعية البحثية، المجموعة الجانبية، والمجموعة المهداة، ومجموعة اللوحات".