طالب الدكتور عمرو الشوبكي مقرر لجنة الحكم بلجنة الخمسين، بتفكيك الفكرة الإخوانية حيث إنها تعيش داخلهم، منوها أن الجماعة دائما ما كانت في مواجهة الدولة تاريخيا؛ لأنهم لا يؤمنون بفكرة الدولة الوطنية، لافتا إلى أن الجماعة قائمة على الفكرة الأممية، ولديهم أدبيات فكر استعلائي؛ ظنا منهم أنهم يحتكرون الدعوة إلى الله.
وقال: إن عصر مبارك كان ذهبيا للإخوان المسلمين، حيث غاب المشروع السياسي للدولة على عكس عصر عبد الناصر والسادات وحتى في عهد الملكية حين حكم حزب الوفد.
وتابع الشوبكي - خلال لقائه على فضائية "سي بي سي" - أن تنظيم الإخوان مارس عمليات العنف والإرهاب في عهد عبد الناصر، مؤكدا أن عبد الناصر نجح في إخراج بعضهم من عباءة الجماعة على الرغم من قناعتهم بالانتماء تنظيميا للجماعة.